針對花蓮地區漁民反映今年1月5日修正「漁船建造許可及漁業證照核發準則」，禁止兼營刺網漁業等規定一事，行政院農業委員會漁業署表示，對既有已經核准經營各種漁業種類之漁民，完全不受影響，仍可繼續從事漁業執照所登載漁業種類，並強調不得從事未經核准漁業種類等違規行為，以免受罰。 另，因刺網漁具易纏繞近岸岩礁，倘不當操作使用會影響海洋生態及環境，有必要加強管制，爰修正列為主漁業之一，規定不得再新增登記為兼營漁業，原已核准兼營者，得兼營至漁船滅失或漁業人變更為止。 但漁業人變更係因繼承或配偶、直系血親間之移轉者，不在此限，以限制刺網作業漁船數量，確保臺灣沿近海漁業資源永續利用，漁民應支持。 政府自民國78年起實施漁船全面限建，淘汰同噸級舊船，才能新建造一艘同噸級漁船，其汰建新船漁業種類須與原漁船主營漁業相同，並規定拖網、延繩釣、魷釣、鰹鮪圍網、鯖圍網、燈火漁業（焚寄網、棒受網、扒網）限為主漁業，不得登記為兼營漁業，管制該等漁業漁船數，避免對資源造成破壞。 臺灣周邊海域漁獲種類多元，隨季節而有不同，因此開放對漁業資源影響較小的漁業種類為兼營漁業，如一支釣、曳繩釣、籠具、鏢旗魚等，並以3種為限，以提供漁民作業彈性需求，兼顧漁民生計。 漁業署說，刺網可能覆蓋於礁岩上導致棲地破壞，同時導致海洋生物意外纏絡死亡，影響海洋生態及環境。據漁業署統計刺網漁船計有12131艘，其中主營為8417艘，兼營3714艘，已逾漁船總艘數之一半，確有必要加強管制。 因此，在106年1月5日修訂限制刺網漁業為主漁業之一，規定不得再新增登記為兼營，原已核准兼營者，得兼營至漁船滅失或漁業人變更為止。 另為兼顧漁民生計及強化保育沿近海棲地生態，改善刺網漁業對海域生態環境之衝擊，輔導刺網漁業轉型，漁業署已訂定「刺網漁業轉型輔導措施」，輔導辦理刺網漁業轉型，共同維護漁業資源。 報導中，有關漁船載客出海釣魚部分，漁業署重申，漁船應從事漁業執照所登載之漁業種類為限，不得違法載客。近年來國人逐漸重視海上休閒活動，一般民眾欲出海從事海上休閒釣魚等活動，可持身分證搭乘核准經營之娛樂漁業漁船出海。