臺灣港務公司高雄港務分公司，轄下安平港通過歐洲生態港認證，成為臺灣港務公司所屬港群第7個取得生態港認證的國際商港，完成最後一塊生態港認證拼圖，領先亞太地區國際商港全部取得歐洲生態港認證的國家。 安平港歷經兩年努力準備及兩階段評核，歐洲海港組織委派查核單位(英商勞氏檢驗股份有限公司)至安平港進行現地查核，經由嚴謹的認證過程，安平港通過「歐洲生態港(EcoPorts)認證」。 高雄港務分公司表示，該次申請生態港認證感謝臺南市政府環境保護局、交通部航港局南部航務中心、內政部消防署高雄港務消防隊安平港分隊、內政部警政署高雄港務警察總隊安平港中隊、行政院海岸巡防署海洋巡防總局第四海巡隊、行政院海岸巡防署海岸巡防總局南部地區巡防局第一海岸巡防總隊、奇美實業股份有限公司以及萬青水泥股份有限公司等單位的合作參與，使安平港生態港認證圓滿順利完成。 高雄港務分公司指出，生態港認證提出2件最佳實踐案例，其中紅樹林生態保育，自民國85年開始進行生態調查與復育，該環境提供了鳥類與魚類絕佳的生存場域，展現復育後的豐碩成果，紅樹林也是天然的護堤屏障，使港區免於海浪侵蝕，具有綠化及防護的功能。 另一案例，為大宗散雜貨一貫化密閉式倉儲設施，裕航國際股份有限公司投入改善運煤船、車裝卸過程產生的揚塵污染，自行研發組裝卸煤機，建置完善之密閉式倉儲設施，同時也大幅提升了裝卸效率。 高雄港務分公司表示，安平港擁有天然的條件，63年因舊港口淤積，利用鯤鯓湖原本潟湖興建安平港，港區環繞台南市二鯤鯓、三鯤鯓、四鯤鯓，歷史文化底蘊深厚，港口興建各階段均注重環境綠化，並創臺灣港口的先例，在港市介面設置連綿隔離綠帶，猶如一條綠絲巾環掛在安平港，港域相鄰安平工業區、台南運河、竹溪、安平漁港，都市的生活律動，經由河海交會脈息相通。 高雄港務分公司指出，安平港生態豐富，綠地面積近60公頃，三鯤鯓漁光島保安林形成天然的屏障，為維護良好生態環境，多年來與臺南市政府充分合作加強台南運河、竹溪、漁港水質改善，設立空氣品質淨區，港勤船舶全部採用低硫柴油、設置岸電，大宗散雜貨管道作業降低噪音、避免揚塵，並與臺南市政府環保局聯合港區船舶、柴油車稽查，每年與各單位舉辦海污聯合演練，成效斐然。 安平港未來以南自貿、北觀光雙軸心發展規劃，自86年起進行港區環境監測，隨時掌握港區環境變化，持續推動岸電設置、落實船舶減速等友善環境作為，並與臺南市政府、鄰近社區等公私部門充分合作，期能帶動港市繁榮發展之同時，打造安平港綠色生態港口永續發展。