有關媒體報導「農委會設石斑魚銷陸作業要點恐衝擊漁民」，稱尚有9成養殖戶未完成登錄，若明(106)年1月1日「輸大陸石斑魚登錄管理作業要點」實施，將嚴重衝擊屏東石斑魚養殖漁民及石斑魚外銷市場一節。漁業署提出澄清說明。 漁業署表示，石斑魚養殖場迄今已有近3成完成登錄，其石斑魚養殖場登錄制度係應國際貿易市場國要求，我養殖石斑魚主要以活魚型態銷售至香港及中國地區，陸方建議註冊登錄自106年1月1日實施，尚未定案，農委會將透過兩岸協商適當緩衝期。 漁業署說，因應世界各國對食品衛生安全日益重視，食品溯源管理已成為國際貿易趨勢，因我石斑魚主要輸銷大陸地區，查陸方「大陸國家品質監督檢驗檢疫總局」於101年3月22日公布「進口食品境外生產企業註冊管理規定」，規範進口食品(含石斑魚等水產品)境外生產企業需申請註冊；為確保石斑魚衛生安全及輸銷作業程序符合大陸地區規範，農委會於103年3月28日訂頒「輸大陸地區石斑魚養殖場登錄管理作業要點」，並輔導養殖漁民辦理登錄，我石斑魚養殖場約1200場，迄今已完成登錄場約3成共322場。 漁業署表示，陸方透由兩岸防檢疫協商機制致函我方，建議臺灣石斑魚輸銷中國自106年1月1日起實施註冊管理，該署考量石斑魚養殖場數眾多，建立生產管理紀錄及現場評核機制，尚需時間繼續推動，並已設定目標今年持續補助產業團體積極宣導及輔導業者申辦，另將與農委會動植物防疫檢疫局共同透由「海峽兩岸農產品檢疫檢驗合作協議」工作會商會議，協商適當緩衝期。 漁業署指出，石斑魚價近期受中國、東南亞生產量市場供過求，該署已採取相關國內促銷措施及召開會議研商強化產業供應鏈，以及鼓勵業者分散風險，拓展大陸以外市場，拓銷日、韓、中東及歐美市場。 基於養殖場登錄管理為國際趨勢，為促進石斑魚外銷，該署籲請未登錄之石斑魚養殖場儘早申辦，如需相關諮詢及輔導可就近洽所在地養殖協會、區漁會等團體，避免自身權益受損。