總統馬英九發表國慶演說時表示，中國當局最近表達有關撤除飛彈的言論，台灣方面認為對兩岸關係有正面的意義，應該「儘早實現」；且台灣安全不能只寄望於兩岸關係的改善，因此發展自主國防力量，持續向外購買無法自製的防衛性武器，是政府「必要與不變的政策」。 中樞慶祝九十九年國慶大會，在總統府前廣場舉行，會前，馬總統伉儷、蕭萬長副總統伉儷，在總統府內接受各國駐台使節及專程來台祝賀的外賓祝賀，外賓人數超過兩百人。 總統夫人周美青身穿旅美服裝設計師吳季剛所贈的禮服，一襲深咖啡色緞面及膝禮服，下襬點綴廿四Ｋ金箔增添喜氣，最受注目。 包括國民黨榮譽主席吳伯雄、親民黨主席宋楚瑜、新黨主席郁慕明等都出席國慶大會，民進黨主席蔡英文、台聯主席黃昆輝則缺席。國民黨榮譽主席連戰也因動手術缺席大會，在ＡＰＥＣ領袖代表人選未定之際，連戰的缺席引發多方揣測。 國慶大會在國防部示範樂隊的軍樂聲中揭開序幕，白嘉莉、王芷蕾、王典等擔任國歌領唱，吳兆南、侯冠群、袁曉婷則以幽默、詼諧的相聲表演方式進行「慶生禮讚」。 但侯冠群一段模仿前總統陳水扁談話的內容，讓行政院長吳敦義一臉嚴肅，也引來側目；袁曉婷稍晚出席國慶酒會時向媒體表示，表演的腳本府方之前都看過。 馬英九以「改革、開創、追求公義」為題發表國慶談話，在兩岸關係上，馬重申，中華民國是主權獨立的國家，政府是在中華民國憲法架構下，以「九二共識」為基礎，開展與中國的關係；馬並強調，台灣已經完全民主化，政府與對岸簽署任何協議，必須受到民意支持與國會監督。 在未來政府施政上，馬英九宣示，未來政府在提高經濟成長同時，一定要設法改善失業與貧窮問題，政府將盡一切努力，調整產業結構，增加就業機會，擴大社會福利，照顧社會弱勢，同時必須推動稅制改革。 有關經濟與環保的爭議，馬明確表示，如果經濟發展對環境有嚴重不良影響或危害時，應該以環保為優先；馬保證，加速創造條件，推動十二年國教，讓五歲幼童免費入學的政策，明年就將擴及全國。 對馬英九的國慶談話，民進黨發言人林右昌表示，過去兩年台灣貧富差距擴大、失業問題嚴重、人權倒退、法官貪污和政府強徵農地等重大爭議，引發了野草莓、白玫瑰及農民夜宿凱道等社運抗爭，儘管馬總統試圖在國慶談話中做出回應，但內容既不具體也沒有清楚時間表，顯得誠意不足。 林右昌說，馬英九的宣示大都是老調重彈，過去兩年卻沒有看到政府具體的作為，真正的問題在於國民黨完全執政卻完全卸責，只負責開支票卻不負責兌現。 台灣需要的是政府的貫徹執行，而不是總統的一再宣示，馬總統一再發表過去已經承諾卻沒有實踐的立場，反而證明了過去兩年多都在原地踏步。