民進黨立委蔡同榮表示，根據掌握的資訊，國安會秘書長蘇起，透過助理指示內政部之海洋探測研究團隊，把台灣周邊海域水文資料交給中國國務院的對口，希望透過中國向聯合國提交台灣近海礁層資訊等海洋公約，除了自我矮化奉中國為宗主國外，該舉動等於協助中國海軍在戰時掌握台灣周邊海域水文狀況，無異開門揖盜。 針對蔡同榮的指控，總統府發言人王郁琦表示，蘇起絕沒有請內政部提供相關水文資料給中國；內政部政務次長簡太郎也表示，他並沒有接獲上級交代與對方交換資訊的指示，應不可能會有這樣的要求。 蔡同榮說，最近一次的秘密會談中，中國國務院官員轉達給台灣學者，表示願與台灣共同探測與開發釣魚台列嶼及太平島，以共同對付日本及菲律賓對這兩處海域主權的爭取，並透過台灣為中國一部分之便，讓中國遂行在東海與南海的戰略擴張。 蔡同榮說，最近五年來，中國海測船常在台灣周邊海域出沒，尤其是花東外海卅到六十浬外海域，包括佳山基地與大鵬灣基地，這些海測船公開任務在偵測中國與台灣海底礁層，以便向聯合國提報中國所屬的大陸礁層範圍，並依此確定中國兩百四十浬經濟海域。 但私下任務是在蒐集台灣海底近海戰略情資，以便中國海軍潛艦與水面艦在這些海域活動。 除了中國，台灣內政部多年前成立台灣海洋資源探測研究團隊，專責台灣周邊海域的海洋氣象、海底礁層、水溫、海底地層探測，包括台大、海大、台師大、清大與中研院等學術機構都參與其中。 蔡同榮說，馬政府上台後，國安會秘書長蘇起就透過助理要求海洋資源探測研究團隊學者，與中國國務院對口單位接觸，交換台灣水下情資，該舉動讓中國如獲至寶，節省許多時間經費。 他透露，去年十二月，包括台大地質系教授魏國彥在內的四位研究團隊科學調查組人員與研究人員到北京，由中國國家海洋局海洋戰略發展研究所所長高之國接待，協商調查事宜。 今年六月海巡署接待回訪的中國海洋局，團員包括海洋局副局長、戰略研究所與杭州第二海洋研究所人員，期間還會見國安會官員。 蔡同榮說，今年七月初台灣海洋研究團隊法政組的中山大學教授胡念祖、政大教授趙國材等四人再度訪問北京，協商由中國替台灣向聯合國提報近海礁層等海洋公約資訊。 而在學者兩次訪中行程中，獲得中國的上賓待遇，除安排住進中南海賓館，並由總理溫家寶、海協會會長陳雲林等高階官員分批接見，在會談中，中方聲稱願意將台灣海底情資代為送呈聯合國，把台灣做為中國的一部分，據以擴大中國海底礁層範圍。 今年十一月中國官員將二度訪台，規劃拜會內政部長、海巡署長等官員。 對蔡同榮指台灣方面學者數度赴中商談此事，以及海巡署接待中國海洋局官員，簡太郎說，海底礁層探勘的成果，在政府內被認定為重要機密，所有參與的學者專家在參與前都被要求簽署保密條款，不可能把機密拿給對岸。 海巡署表示，今年六月份，胡念祖教授召開學術研討會，確曾邀中國海洋局官員來台，海巡署也是受邀單位之一，但僅是派人參與論壇，並沒有讓中國海洋局官員參訪。 而蔡同榮所指赴中商討海洋調查事宜的學者，台大地質系教授魏國彥說，他和此事毫無關係，更從未參與，他也不記得去年十二月有去北京。 政大教授趙國材和中山大學教授胡念祖則都手機關機，透過校方也無法取得聯繫，至深夜仍未能得知其回應。