根據環保署97年水庫水質監測資料，國內重要水庫水質7座呈現優養化情形，較96年5座新增2座。 水利署副署長吳約西表示，水庫水質被誤解較96年惡化，主要為新增兩座水庫係明德水庫指數由49.47略增為50.03以及96年因疏浚未實施監測的鏡面水庫等原因，其餘並無明顯較差水庫。 反倒是有8座水庫優養程度較96年減輕包括新山、翡翠、寶山、德碁、蘭潭、仁義潭、澄清湖、鳳山等水庫，其中鳳山水庫優養指數更是從76.73大幅下降為71.89，較上年減4.84最多，翡翠水庫則從43.77降為38.94，減4.83次之，澄清湖水庫也從54.68降為51.39，減3.29。 整體而言97年水庫水質並無明顯惡化，自來水供應品質尚不受影響。 此外，供應北縣及桃園縣民生用水的石門水庫指數從前一年的48.17增為49.21略增加1.04，北水局長賴伯勳表示，因水庫水質監測有人工及自動兩種並於水庫水域不同深度監測而有不同結果出現，該局會隨時掌握水庫不同水深水質變化，並依水庫水質不同高程取水，提供良質原水，經該局監測結果，目前石門水庫水質符合飲用水水源水質標準範圍，請民眾安心。 吳約西說，水庫集水區因人為開發不當與污染物排入水庫，導致水質優養化，影響民眾用水衛生及安全，該署針對自來水供水為主的水庫，均依據自來水法第11條規定劃設自來水水質水量保護區，並且依自來水法有關規定加強各項管制事項。 吳約西表示，為加強水庫集水區保育治理，涵養水源及改善水庫水質，行政院已於95年3月20日核定「水庫集水區保育綱要」，水利署仍會持續依該項綱要規定加強辦理水庫蓄水範圍及保護帶的保育治理工作，同時彙整交通、林務、水保等相關單位計畫進一步研擬水庫集水區保育計畫，報核後落實辦理集水區的保育治理。 環保署則配合辦理「河川及海洋水質維護改善計畫」，加強河川及水庫水質改善工作。 目前已優先推動翡翠、石門、德碁、曾文、霧社、日月潭等水庫保育實施計畫，相信全台重要民生用水標的的水庫水質將會持續有所改善。