南投縣政府表示，為有效解決鯉魚潭水質日益惡化之問題，提升到訪遊客之旅遊品質，環保局於97年積極向行政院環境保護署爭取補助經費，辦理「南投縣鯉魚潭水質改善暨細部設計計畫」。 主要針對鯉魚潭集水區調查與評估點污染源、非點污染源、潭底泥、現有藻類、觀光開發等對鯉魚潭水質之影響，並據以規劃鯉魚潭周邊區域內整體水質改善對策。 環保局表示，縣長李朝卿非常重視縣內觀光產業之振興，為提昇鯉魚潭旅遊品質責成該局爭取中央經費進行鯉魚潭改善計畫。 該計畫已於97年完成發包，環保局目前正積極辦理調查、評估事項，預計於98年7月完成初步之整體改善規劃報告，該局將依據該規劃報告書內容逐步，向行政院環境保護署逐一申請後續辦理水質改善事宜所需經費，使埔里鎮鯉魚潭逐漸回復往日山明水秀的景象，成為民眾遊憩的好所在，以及遊客到訪埔里鎮時不可不到的重要觀光景點。 位於埔里鎮東南方之鯉魚潭，早期因潭內產有高貴魚類「鱺魚」而得名，整個潭面約二十甲，四周景色優美，有小西湖之稱，是本縣具有觀光發展潛力之景點。 近年來南投縣政府致力推動縣內各觀光景點，帶來鯉魚潭周邊觀光遊憩人潮，潭畔住家、民宿業者也隨而增加，環保局發現部分商家將產生之污水直接排放到潭內，使得潭內原本已缺乏溪流活水注入及因集水區內之週邊山泉水源、水量降低，促使水域中之氮化物和磷酸鹽濃度增高，造成藻類大量繁殖，加速形成優養化之現象亦導致水域生態環境的急速改變，使得水質惡化之趨勢愈加明顯。