為發揮加工出口區「產業群聚」效應，帶動加工區發展，加工出口區管理處與工研院簽定「加工出口區推動產業群聚計畫」，希望擴大群聚效應，建構完整產業體系，以降低廠商生產成本。該區所轄楠梓園區為IC封測專區、高雄園區為LCD零組件專區、台中園區為光學及電子相關產業專區、中港園區為精密工具及面板產業專區、屏東園區為太陽能專區，產業群聚效應均已大致形成。 管理處表示，去年11月以來全球經濟表現未盡理想下，引發產業憂心，國內景氣趨緩，固然受到全球金融海嘯影響，倒不如說是更突顯台灣產業正面臨轉型瓶頸，為利用區內群聚之產業鏈分析，促使區內產業轉型，目前各園區業雖已形成產業聚落，但群聚效應僅限於各單一區間，並未完全發揮跨區產業群聚強有力之效應。所以透過公開評選出輔導廠商之經驗豐富執行單位工研院來強化區內群聚力量，總執行時程為1年，執行推動日程為97年11月至98年10月。 值得一提的是，執行此計畫中98年1月下旬經深度訪談楠梓區廠商興亞電子公司，針對該公司產業技術開發計畫，進行政府資源補助輔導。興亞電子當場希望管理處協助申請經濟部技術專案－產品瑕疵的檢查系統升級，減少成本，並提升產品品質，增進產品的競爭力。經管理處及工研院實地到廠商實地勘查現場後，了解到該公司除產品瑕疵的檢查系統升級外，廠房內生產線乾燥爐技術問題亦需改善。隔天管理處旋即派2位工讀研究生暨工研院等至廠協助撰寫計畫書，以便利其能儘速申請，據聞現今計畫已接近完成階段，至於生產線乾燥爐技術問題，已安排工研院能環所提供解決方案。 管理處進一步表示，在各園區既有之產業群聚特性和優勢下，期望整合及建立跨加工區、科學園區、自由貿易港區、大陸台資及外資廠商間廠商產業價值鏈體系，創造水平產業群聚間合作機會，並發掘產業群聚缺口，輔導廠商向政府專案計畫之權責單位、學校、研究單位等提供協助，依個案全程列管追蹤，並協助廠商進行兩岸互動合作交流，整體提升產業群聚效果及國際競爭力。