因應嚴重特殊傳染性肺炎(COVID-19）疫情發展，臺大雲林分院探病管制措施再趨於嚴格，自3月20日起，探病時段由單日2次降為1次。一般病房時間為上午11時30分至12時30分。加護病房探病時間為11時至11時30分。每位住院病人限制2人探病、1人陪病。院方呼籲民眾配合防疫措施，鼓勵以電話或視訊問候，以保護個人及家人之健康安全。
臺大醫院雲林分院表示，為確保民眾健康及醫療環境的安全，配合衛生福利部疾病管制署規範，請民眾進入醫院內務必配戴外科醫療口罩，攜帶健保卡或身分證件，在醫院入口處設置8組查驗健保卡專屬之讀卡機，並有工作人員引導民眾快速通關，螢幕呈現綠燈表示確定旅遊史無虞，方可進入醫院；如發現讀卡異常，有14日內旅遊史之民眾，如有看診需求，則由專人帶往戶外疫病門診看診。提醒來院門診陪病家屬，包含幼童、嬰幼兒也務必攜帶健保卡或身分證件以便查驗。
臺大雲林分院表示，院方自2月12日起提供「居家隔離檢疫通訊診療服務」，接受居家檢疫隔離民眾如有慢性病處方及其他非上呼吸道感染或發燒症狀之就醫需求時，可透過1922專線，經衛生單位與醫院評估，且同意接受智慧手機遠距離通訊診療者，由院方專人聯繫個案並預約通訊診療時間，透過「視訊診療」，提供初診或複診的服務，運用遠距與科技的便利性，讓醫療照護零距離。
臺大雲林分院提醒，因應疫情變化敬請隨時關注武漢肺炎（新型冠狀病毒）疫情之相關動態新聞與發展情勢，做好個人防疫工作，將依政府公告及疫情動態相關變化調整相關規定與措施。防疫期間，許多需要民眾配合的措施造成不便與困擾，敬請支持與體諒。