南投縣政府6日下午，在消防局舉行南投縣嚴重特殊傳染性肺炎第七次應變會議，縣府疫情指揮中心與中央同步提升應變等級，由二級提升至一級開設，由於國內已有院內感染發生，指揮中心也決議縣內10家醫院，除了加護病房、安寧病房及經醫師醫療專業同意者外，其餘一律禁止探病，以免院內感染引發社區傳播。
南投縣副縣長陳正昇表示，目前國內共有44個確診案例，這2個禮拜更是關鍵期，縣府各單位務必進行分工整備，為防疫工作做好萬全準備。
衛生局表示，目前中央建議集會活動之主辦單位應評估該活動的必要性，對於非必要的人潮密集活動，考慮延期或暫緩舉辦，陳副縣長指示，如果主辦單位經過評估，還是決定辦理集會活動，對於參加者的身份資訊，應充分紀錄掌握，以利後續疫情發生時的追蹤掌握。
社會及勞動處表示，縣內社福機構及長照機構服務單位、兒少機構院生每日需求數量3020片口罩，目前有不足的現象，建請指揮中心協助爭取。另外，公務機關為監測疫情，對於洽公民眾，需用額溫槍進行體溫量測，由於目前額溫槍普遍缺貨，指揮中心也將調查各單位需求數量，再統一向經濟部進行採購。
日前媒體報導香港有犬隻經檢驗呈現弱陽，成為全球首例，引發民眾擔憂，家畜疾病防治所表示，目前尚未有研究證實冠狀病毒會經由動物傳染給人類，民眾不需特別預防動物傳染，且中央會加強預警，請民眾不用過度恐慌。