小琉球自來水來自牡丹水庫，經由250mm及200mm的海底管線送到琉球鄉，再經配水池儲水供應居民日常用水，每日約2,500至3,800噸，但一到暑假高峰旅遊潮，用水量就會暴增，加上小琉球屬管線末端，自來水公司表示，須謹慎調度供水。 自來水公司表示，日前，輸送到島上的海底管線受到颱風及潮汐大浪衝擊下，造成了海底管線保護套管脫落，為穩定當地居民供水正常及用水品質，以及漁、客輪船行駛安全，水公司七區處將原管線重新設計，以更耐用的保護套管，將口徑200公厘海底管線全面包覆，達到保護管線作用，工程已於108年4月竣工完成，除了提升正常供水品質以外，更可讓居民享有更穩定優質的自來水。 長期關心小琉球地區海洋生態，小琉球海洋志工隊發言人洪桂蓮表示：有去勘查海埕外自來水狀況，已經完成重新固定了。特地寫信感謝縣政府及自來水公司的用心。 水公司七區處王明孝處長表示，提供質優量足的自來水是自來水公司的使命，為改善用戶用水品質，水公司對離島供水，除定期供水管線維護外，目前亦積極提升小琉球地區蓄水容量，穩地離島地區供水。面對全球性的氣候變遷，自來水水源取用條件日趨嚴苛，供水難度增加，水公司為留住珍貴的水資源不遺餘力，也期望民眾將節水觀念融入日常生活中，共同攜手打造不缺水的環境。