財政部關務署高雄關擴大現行關港貿單一窗口資訊整合與共享功能、強化風險管理以提升供應鏈安全為目標，同時藉由海關會同各邊境簽審機關執行共同查驗，以達到避免重複開櫃查驗、降低業者通關成本之目的，高雄關與食藥署共同查驗 為業者再創通關優勢。 海關推動協同邊境管理之初步階段，係選定同屬規範應於貨櫃集中查驗區執行輸入檢驗、抽（看）樣作業之食藥署作為協同合作機關，期達到「一次申報、一次查驗、一次放行」之目標，食品相關輸入業者若符合共同查驗資格者，即得向海關申辦，除能有效節省重複查驗所衍生之貨櫃吊櫃、拖移、場地使用與開櫃、拆包、開箱、搬運、復原等費用負擔外，亦得同時完成海關人工查驗與食藥署輸入查驗作業，大幅縮短通關時程，提升業者之市場競爭力。 高雄關表示，經統計自去(105)年12月正式實施起至本(106)年8月止，該關與食藥署南區管理中心執行共同查驗者，計達292份進口報單與338只貨櫃，機關間互動合作良好，其政策美意亦深獲業者好評，復為推廣業務協同合作之概念，該關於本年6月15日舉辦「高雄關提升邊境協同管理（CBM）執行成效座談會」，邀集經濟部國際貿易局高雄辦事處、經濟部標準檢驗局高雄分局、衛生福利部食品藥物管理署南區管理中心、行政院農業委員會動植物防疫檢疫局高雄分局及高雄市報關商業同業公會等與會，研討交流、建立合作共識，未來將就現有共同查驗機制，由食藥署推展至防檢局、標檢局等簽審機關，以擴大協同邊境管理之成效，提升業者通關查驗之效率與服務品質。