依遠洋漁業條例授權訂定的「境外僱用外國籍船員許可及管理辦法」於106年1月20日生效，對於業界憂慮目前已依原規定報准僱用的船員如何處理問題，漁業署說，原僱用契約未到期者，繼續僱用，不會受到影響。 漁業署指出，遠洋漁業條例第46條第4項規定，該例施行前，已依漁業法規定核准在境外僱用外籍船員者，於該條例施行後視為取得在境外僱用外籍船員之許可。 也就是說，原本已經依照漁業法規定核准僱用的外籍船員，在契約未到期前，可以繼續僱用，現有境外僱用外籍船員約1萬8千人及依就業服務法正式引進國內的外籍船員約1萬1千人，均不會受到影響。 漁業署表示，目前高雄市、屏東縣及宜蘭縣等遠洋漁業重點縣市，均已有仲介公司完成繳交保證金向該署提出核准申請，該署已加速完成審核程序。 此外，包括漁會、協會等產業團體亦有意願考量加入辦理仲介業務，外籍船員僱用管道可以維持順暢無阻。 另外，漁業署考量年節將屆，仲介業者短期內籌措保證金或有困難，在期限內，仲介公司轄管縣(市)府同意其以本票擔保者，可先辦理申請仲介核准。 漁業署說，新法實施不會造成外籍船員短缺問題，而且新措施係強化仲介及外籍船員僱用之管理，同時加強船主及受僱者的權益的保護，是雙贏的措施，業界應共同支持，以維護遠洋漁業產業的國際形象。