臺灣港務公司鑒於莫蘭蒂颱風造成高雄港嚴重災損，即於9月23日召集所轄各分公司、交通部航港局、航運業各相關公會及高雄港內各公民營機構等，研商強化商港防颱應變資源及組織整合機制，會議中已將區漁會、海軍、海巡署、高雄市政府海洋局等機關納入聯絡通報系統，在梅姬颱風侵襲期間，港務公司吳董事長亦分別於9月27日及9月28日兩次親臨防颱中心督導轄屬各港防颱作業。 有鑑於9月14日強颱莫蘭蒂侵襲，高雄港內公民營事業損失嚴重，為67年賽洛瑪颱風後最嚴重的颱風災害。接續27日中度颱風梅姬再度侵襲，高雄港平均風力最強達12級、陣風14級，鑑於莫蘭蒂颱風經歷，港務公司即聯繫督促港區各公民營事業及航商業者轉知港內避風船隻，並配合加強防颱繫纜等應變措施，幸經港區各事業機構落實各項防颱措施，高雄港內未再發生船舶斷纜碰撞重大災損事件。 強颱莫蘭蒂9月14日侵襲高雄港，高雄港平均風力達14級，最大陣風達17級以上，造成港內船舶受強風吹襲陸續發生斷纜漂移，計有10艘商船、前鎮漁港亦有4艘大型遠洋漁船斷纜漂移進入高雄港水域，造成損災最嚴重的颱風。 各船斷纜在港內水域漂移碰撞，最嚴重的是臺灣國際造船公司尚建造中之「風明輪」（1.4萬TEU級貨櫃船），斷纜漂流撞擊110號高明貨櫃碼頭及岸上貨櫃起重機，3台全毀，1台嚴重損壞。 因風明輪右舷前後分別被110號碼頭貨櫃起重機2台倚附，災後3天仍留滯在110碼頭，影響高明公司及高雄港之營運，港務公司積極介入，召集高明公司、臺船公司等先後於9月19及22日兩次開會研議並審查台船公司提送之受損起重機及風明輪移回作業計畫，督促台船公司轉飭廠商趕工，於9月25日夜間始確認完成風明輪右舷上起重機拆卸完成，於26日晨7點執行風明輪移泊返回台船，並直接進入該公司船塢。 另前鎮漁港4艘大型遠洋漁船原併排綁缚在漁港內避風，因不堪強風吹襲，繫靠岸際最裡面之富冠707號斷纜後，4艘綁缚一起漂流進入高雄港水域，高雄分公司派2艘拖船仍無法控制，最後漂移到西子灣擱淺，4艘漁船計有22名船員工，除一名本國籍看船漁工在攀爬消波塊登岸中落海罹難外，其他均順利脫險，漁船2艘已報全損。