依房屋稅條例第15條第2項第2款規定，合法登記之工廠供直接生產使用之自有房屋減半課徵房屋稅，其前提以合法登記的自有工廠為限，申請時必需檢附工廠登記證供稅捐機關查核，違章廠房因現行工廠管理輔導法規定，不得許可設立，無法取得工廠登記證，難認屬合法登記的工廠，依法不得減半課徵；另於合法登記的廠房同一圍牆內自行增建無使用執照的違建廠房亦不適用。