臺灣港務公司表示，雖然高雄市政府規劃興建旗津跨港觀光纜車，是基於觀光層面出發，並將以BOT方式招商辦理，如果這項規劃方案對高雄市未來發展有利，臺灣港務公司基於港市共榮，均樂觀其成，但此規劃方案並非由高雄市政府單方面規劃即可成就，尚攸關高雄港未來發展，事涉中央權責事務，實應由地方與中央進一步協商，獲得共識後再行推動，始屬妥適。 臺灣港務公司表示，高雄市政府規劃採BOT方式興建旗津跨港纜車，纜車路線由新光公園到旗津海岸公園，必須穿越高雄港主航道、支航道及中島商港區。所穿越區域為船舶進出高雄港之重要航道，涉及航行安全、港口保全及淨高等技術性問題，必須妥善評估始能將對高雄港未來發展降至最低。 因高雄港為臺灣主要國際商港，興建跨港纜車影響港口發展甚鉅，臺灣港務公司將進一步與高雄市政府共同研商該案，使市府所規畫之纜車興建方案，不僅可促進地方發展，也不致影響高雄港之未來營運及對國家整體經濟之發展。