有關媒體報導「航港局違法妄為」許可中國「華電1001號」工作船來台，引起民眾關切討論，航港局針對此事提出澄清。 航港局說，依現行規定，非運送客貨之各類船舶申請航行台灣地區與中國地區港口者，應依「台灣地區與中國地區海運直航許可管理辦法」第七條規定，申請專案許可，非中華民國國籍船舶停泊國際商港以外之其他港灣口岸，應依船舶法第八條規定申請特許。 航港局指出，此次中國籍「華電1001號」工作船來台申請案，該局依「台灣地區與大陸地區海運直航許可管理辦法第七條」與「船舶法第八條」，以聯合審查會方式會商國家安全局、行政院大陸委員會、海岸巡防署、經濟部、國防部、財政部、內政部入出國及移民署、相關地方政府等有關機關進行審查。 該工作船組由南通直航台中港，合於台灣地區與大陸地區海運直航許可管理辦法第七條規定，各機關均無反對意見，原則同意該案直航許可，至於來台作業，該局已於九月二十二日召開「大陸籍起重平台船-華電1001-勘查小組工作會議」，經討論認為大陸工作船於航行或施工期間，船上設備有取得相關水文資料影響國安之疑慮，在目的事業主管機關經濟部能源局及業者，對施工影響國安之疑慮未釋疑前，不同意該工作船到彰化外海施工，並請該工作船暫不來台。 航港局表示，該局等本案目的事業主管機關經濟部能源局及業者，針對使用大陸工作船對國安的疑慮，提出說明釐清或提出替代方案後，將配合邀集相關機關再召開會議審議，在達成確保國安無虞的共識後，大陸工作船才能來台。 航港局說，該局受理類似案件，均依循法令，依法會商相關單位，並以短期及個別專案方式准駁，嚴格限制工作期間、地點、程序，應與現行相關規定相符。