國際肥料價格上漲，政府於97年5月30日調整國內肥料價格，由農委會補貼漲幅之7成，於6月13日再比照汽油漲價之多元吸收原則，協調台肥公司配合農業政策，吸收部分肥料漲幅。台肥公司同意吸收肥料漲幅之 15 ％。經由政府及台肥公司補貼及吸收漲幅85﹪後，15%由農民負擔。農友購肥價格平均漲幅由42.6﹪再降為22.3﹪。 以尿素為例， 5 月 30 日調整前價格每包 360 元～ 370 元，經政府補貼原調漲後價格每包 520 元～ 530 元，漲幅 43% ，再經台肥公司吸收後，調降為每包 445 元～ 455 元，降低 75 元，漲幅降為 23 ％，其它各項主要化學肥料均依比率調降。計格調整經政府補貼吉台肥公司吸收後，農民購買尿素價格每公噸11250元，與鄰近國家日本之21850元、韓國之23300元、中國大陸之16120元相較為低。 為確保農業永續經營，農業耕作應合理化施肥，節約化學肥料使用，農委會將規劃擴大推廣國產優良有機質肥料，並依農友各種作物耕作特性，提高推廣面積與數量；另加強推廣冬季休閒期種植綠肥作物，維護農田地力，減少化學肥料使用，以降低農產品生產成本之衝擊。