台灣家禽屠宰衛生檢查率未達7成，每年有1億1,600多萬隻家禽在沒有經過檢查的情況下就於市場上販賣，平均每天達31萬隻；直到現在嘉義市、新竹市、基隆市、新北市連1間家禽屠宰場都未設立。 根據防檢局統計，家畜屠宰衛生檢查的比例已經超過九成三，不過家禽前年的檢查比例只有近七成；土雞不到四成、鴨與鵝有八、九成、白肉雞達九成九，關於去年的數據還未出爐。 台灣動物社會研究會執行長朱增宏表示，每年還有1億1,600多萬隻的家禽未經過檢查就流入市場，如果用每戶買1隻來推算，每天大概會有約31萬戶的家庭購買到未經過衛生檢驗的雞肉；再以家禽屠宰檢查不合格率的3%估計，平均每日有將近9,500個家庭將對可能存在著健康風險的肉品吃進肚。 為了落實家禽屠宰衛生的檢查，行政院於2006年推動了「傳統市場禁宰活禽」政策，且輔導業者要設置家禽屠宰場，然而該政策卻於2010年4月1日政策正式上路的前5天喊停，防檢局表示，除了屠宰場以外，家禽還可以於自宅或是傳統市場屠宰。 電宰公會總幹事卓沛宏說，土雞進入屠宰場的比例不到四成，於傳統市場的屠宰比例占約1成五，換言之，近一半是私宰。他說，傳統市場是沒有經過衛生檢查，但對消費者要負責，至少家禽來源要以白紙黑字記錄；而送至屠宰場的家禽，每隻鵝、雞、鴨皆會經由屠宰獸醫師的把關，確認衛生安全無虞才會出貨。 中華民國養雞協會理事長王錦田表示，土雞在衛生管理和飼養上已經有顯著的進步，屠宰衛生率也大大上升，但是推動不可以太過急躁；他說，傳統市場屠宰還是有存在的必要，需要考量到國人喜愛吃溫體肉的需求。部分的雞農也想要用衛生屠宰的方式，可是全台第二大消費市場的新北市，居然連一間屠宰場都沒有，那要叫雞農怎麼改善、配合。 防檢局說，新北市家禽屠宰場還在申請新建審查作業，目前的情況可以送至北市或桃縣屠宰；嘉市、竹市、基隆因為交通便利、轄區小，建議可以送至附近縣市進行屠宰。家禽衛生屠宰率有逐漸攀升，以去年來說，整體衛生屠宰量雖然維持在2億6千多隻，不過因為產量下降，因此在衛生檢查比例上可望會比前年要高。