曾文水庫水域廣闊，景色美不勝收，魚類資源豐富，往來遊艇和船筏眾多，水資局也在曾文水庫水面上設置許多攔污索，用以阻擋漂流木等污染物，不料卻因為留下的航道寬度只有六點五公尺，對往來船隻行船安全造成極大的威脅。經當地居民多次陳情反應，南區水資局也認為事涉行船安全，將會積極檢討改善。 近幾年來，每逢汛期颱風期間，就會有大量的垃圾雜物和漂流木被沖入曾文水庫水域，為避免這些大量的漂流木等雜物污染水庫水質，或漂流至水庫大壩堵住出水口，在便利清理管理的前提下，南區水資局斥資二千萬元，在曾文水庫水面上，佈下許多以浮桶和鋼索組合製成的攔污索，並設置寬六點五公尺的開口，供船隻可以通過航行。 只是許多遊艇和船筏業者表示，用攔污索阻擋漂流木等污染物，原是好事一樁，但因為可供船隻通過出入口只有六點五公尺，對往來船隻行船安全威脅很大。 遊艇業者表示，平常在走就很擔心會撞到浮桶，遇到風浪較大時，船隻控制不易時，更嚴重危及行船安全，造成不小威脅。今年二月初，水資局自己船筏在攔污索出入口撞到平台構造物，除船筏受損，平台構造物也被撞毀，因而建請管理單位正視攔污索出入口寬度不足，危及船隻安全一事，以免發生事故造成人員傷亡。 對此，南區水資局回應表示，為維護水庫潔淨，攔污索設置有其必要，至於留下的通行開口寬度六點五公尺則是全國統一的標準規定，各水庫都一樣。只是因為曾文水庫漁民作業多以二艘船協同進行，才會產生問題，若財源不成問題，會配合民眾需求進行改善。