南投縣水里、埔里及竹山地政事務所經清查經濟部水利署已公告卓棍溪、郡坑溪、水里溪、塔羅灣溪、濁水溪上游及加走寮溪等河川區域之土地，並已造冊完竣(包括公、私有土地)。為確保土地所有權人之權益，縣府亦將清查結果，送經濟部水利署第四河川局逐筆確認無誤；除以公文通知各土地所有權人外，土地所轄地政事務所亦提供閱覽。 卓棍溪、郡坑溪、水里溪河川區域，經濟部在96年公告、塔羅灣溪河川區域經濟部於93年公告、濁水溪上游河川區域經濟部於101年公告、加走寮溪河川區域經濟部於95及98年公告。 依「製訂非都市土地使用分區圖及編定各種使用地作業須知」第7點規定，經水利主管機關依法公告之河川區域內或水道治理計畫線或堤防預定（用地範圍）線內之土地，並以其較寬者為界劃定，須檢討變更為河川區。 故縣議員府近期將依「製訂非都市土地使用分區圖及編定各種使用地作業須知」規定辦理改劃為「河川區」作業。