總統馬英九表示，他在兩岸關係中提出「互不承認主權、互不否認治權」，是目前最務實，也最能夠解決問題的方案。 前陸委會主委吳釗燮表示，中國原本就不承認台灣擁有主權，未曾放棄一個中國原則，馬的說法一廂情願，他懷疑中國能否接受。 台灣智庫諮詢委員董立文說，馬英九只提「兩個互不」，卻不提對我國有利的「互相承認」，令人憂心。 吳釗燮說，自一九九一年前總統李登輝宣布廢止動員戡亂時期臨時條款，台灣就已承認中國的統治合法性，承認中國擁有主權和治權，兩岸是對等的政治實體，馬的說法反而和現實脫節。 吳釗燮說，中國向來不承認台灣主權，而馬英九心中的主權及於中國，這也不是中國可接受的，「兩個互不」只是馬單方面的思考。 董立文說，北京始終不願正面回應馬英九的「一國兩區」和「兩個互不」，原因在於「一個中國」等同中華人民共和國，在國際間已有壓倒性的勝算，北京沒有必要和馬討論主權問題。 董立文說，北京態度很清楚，就是「讓馬說他想說的」，北京做自己想做的，也就是把「一中框架」帶到台灣。 董立文表示，兩岸政治談判三部曲，應是從互不承認、互不否認，最後走向相互承認，如果國民黨有心維護中華民國存在，就應該提「相互承認」，但馬卻刻意避談，這才是令人擔心之處。 吳釗燮表示，兩岸交往應要以現實為基礎，只要中國不承認台灣擁有主權的事實，不管我方怎麼詮釋兩岸關係，都會掉入一中框架；兩岸進行協商或政治性談判，也會被國際社會解讀為台灣是中國的一部分。 吳釗燮說，兩岸的現狀就是台灣是主權獨立國家，馬英九在選舉時也說台灣前途只有台灣人可以決定，馬英九在當選後講「一國兩區」，等於違反選前承諾。