台南市政府表示，南市於5月19、20兩日連續大雨，永康、仁德、歸仁區排水宣洩不及造成部份地區淹水，影響該市環境及民眾生活，該局為儘速協助受災地區環境清理，當日即由各區公所指揮，台南市政府環保局依公所需求前往各淹水區里進行環境清理工作。 5/20為非正常垃圾清運日，該局為因應此災後特殊需求，永康區清潔隊於5月20日當日支援22人次，垃圾車1輛、抓斗車1輛，並隨時視情況支援現場環境清理及垃圾清運工作，當日清理近0.3噸垃圾，協助民眾儘速恢復日常生活作息，21日則支援50人次、垃圾車5輛、抓斗車2輛，清理近30噸垃圾。 另於北區、永康、仁德及歸仁等行政區因積水及部分道路封閉，該局於5月20日當天第一時間趕赴現場會勘各區淹水情形，並立即動員130名人力、8輛垃圾車、6輛資源回收輛及1輛抓斗車，協助災區環境清理及復原工作，當日清除約7噸巨大垃圾，如泡水傢俱、樹枝…等。 台南市政府環保局為災害防救工作後續環境清理單位，為儘速恢復市容美觀及保障該市環境衛生，該局同仁無不兢兢業業，視災害防救工作為本局優先業務。對此，當日災情發生後，該局同仁即迅速前往各災區，協助各項環境復原事宜。針對各里提報至公所的需求，該局同仁無不盡力配合，迅速完成災後復元事宜。