雲林縣政府表示，台塑六輕麥寮廠二氧化碳年排放量占全國排放總量百分之二十六，雲林縣縣民比其他縣市人民多承擔七倍的溫室氣體排放量。 公課採「原因者付費原則」，以量課費，所增加之地方財政收入，用來作為環境品質維護及改善之用，因此雲林縣政府強調，污染者付費 碳費徵收有理。 雲林長期飽受環境的污染，創造國家GNP亮麗數字，數百億稅收上繳中央，卻讓鄉親承擔全國1/4二氧化碳排放量，蘇治芬強調，中央統籌分配款無法彰顯照顧地方的政策，希望中央能提出照顧雲林的對策，就能解決碳費的問題，而非一昧在「二氧化碳屬於跨區域性環境污染」等文字上打轉。 縣府環保局表示，「碳費」有助於減少二氧化碳排放量，由雲林縣政府來制定則具因地制宜之效，俾為向污染源肇因者或產品製造商收取「碳費」之標準及依據。 課徵「碳費」符合地方制度法有關自治財政原則，亦具有綠色租稅改革及地方財政自主之雙重效果。六輕工業區自商轉以來，於雲林縣境內排放多項污染物，部分空氣污染物雖依法徵收空氣污染防制費，然多項溫室氣體卻因中央立法延宕，遲遲無法通過「溫室氣體減量法」，造成雲林縣民眾須承受比其他縣市人民多達七倍的溫室氣體排放量，對雲林縣民眾並不公平，因此雲林縣政府強調，污染者付費 碳費徵收有理。