台南市政府表示，台南市議員林燕祝、黃麗招、李文俊2日聯合質詢安南肉品市場積弊成習，長期淪為政治酬庸。林燕祝議員表示，市府雖占70％股份，賴清德市長兼任董事長，市府另有4席董事、2席監察人，但總經理陳來助完全不理會董事會決議，連審計部台南審計處所列缺失也置之不理。他們指出，安南肉品市場總經理不顧審計處和台南市政府早在98年就要求採單一薪給制的肉品市場不能再發放年終獎金和其他沒有支領依據的獎金，卻仍然續發年終獎金，更巧立名目發放三節獎金、開工獎金等等，明顯是自肥，拿納稅人的錢圖利市場員工。同時員工資格、毛豬拍賣資料管理系統、工程施作也有問題，要求政風單位應該介入調查。 政風處長侯鴻基表示，安南肉品市場88、89年3名員工拿不實的「在職證明」取得較高的薪點起敘，遭地檢署緩起訴處分，市府已提請民事訴訟追討溢領薪水，對於其他相關缺失，台南市府也已進行調查，將事證移送法辦。 針對安南安南肉品市場問題，賴清德表示，台南縣市合併升格，他是第一任市長，他有決心替大台南建置一個制度，讓大台南能夠進步。如果有任何違法的事情或弊端，他絕對堅持改革，不會護短，也不會徇私，更不可能掩飾違法的事情。賴清德並指出，議員所指教許多是過去已經發生的，他會盡速了解詳細內容，要求總經理應該依法追討溢領的薪水，工程若有違法缺失要移送法辦。另外，台南縣市合併升格後，為業務穩定而留任所有人員，安南及善化肉品市場預定在今年8月進行合併，會利用組織改造機會檢討汰除不適任人員，未來新進人員也會透過公開招考方式任用，以提昇肉品市場的效率與服務品質。