台南市政府表示，市區鐵路地下化計畫，正如火如荼進行中，除了計畫主體工程外，對於沿線交通橫交設施的處理也有所進展。 經副市長林欽榮率領之推動小組不懈地與交通部溝通下，對於廢除小東路地下道、民族(四維)地下道、林森路地下道、及中華東路陸橋已達共識，並將爭取納入鐵路地下化工程一併辦理。 「臺南市區鐵路地下化計畫」對臺南市區交通影響甚大，為使該工程執行能順遂推動，市府與交通部相關單位共同成立「臺南市區鐵路地下化計畫」推動專案小組溝通平台，由林長欽榮與交通部次長郭蔡擔任專案小組共同召集人，期望透過溝通平台協調研商，共同推動該計畫。 依行政院原核定之綜合規劃，除小東路地下道、民族(四維)地下道、林森路地下道、中華東路陸橋外，其餘交通橫交設施將拆除或填平。 因臺南市區鐵路地下化將採全線明挖覆蓋搭配管幕工法，經臺南市政府評估，上述4項交通橫交設施於鐵路地下化完工後將失去其功能，反而阻礙都市整體發展，在臺南市政府極力爭取下，已與工程主辦單位交通部鐵路改建工程局達成廢除共識，惟經費概估約7.2億元，後續將藉由專案小組溝通平台持續協調研商，爭取納入鐵路地下化工程一併辦理。 「臺南市區鐵路地下化計畫」於98年9月9日奉行政院核定，工程北起臺鐵永康站南端之中華陸橋（永康橋）以南約0.17公里處，南至生產路以南約1.91公里，全長8.23公里，除預定將原臺南車站改建為地下站，並新增林森、南臺南地下通勤車站，途經9處平交道、8處地下道(5車行、3人行)、6處陸橋/鐵路橋涵，工期約7年8個月(含設計階段)，總工程經費約293.6億元。 目前該工程細部設計、機電系統設計、環境監測等前置作業正積極進行中，另外週邊工程業已發包施工，依規劃時程，永久主體工程預計將於101年動工，106年5月完工。