台南市政府表示，台南河水庫因淤積嚴重，有644公頃農田一期非自願性被迫休耕，休耕農地目前只獲得農委會同意每公頃4萬5千元的補助，與99年八八風災所造成之嘉南地區一期作休耕的8萬元補助差距甚大，嚴重影響農民權益。 市長賴清德曾多次向中央爭取補助金額應比照八八風災之標準提升至每公頃8萬元，惟中央單位皆以未移撥農業用水為由而無法同意。 賴清德為體恤民困，採納市議員張世賢、陳文科、洪玉鳯及蔡淑惠等議員之建議，在市庫財源不佳的情況下，同意由市府籌措預算支應，再補助休耕農地每公頃1萬5000千元。 市府表示，為將這次爭取停灌補助的情形公開說明，市府今天舉行「白河水庫100年第一期作停灌區爭取補助記者會」。 賴清德首先向出席的議員表達謝意，感謝議會在農業政策上的推動與支持，賴清德接著進一步向在場的農民說明，白河水庫淤積多年，清淤不力，實非農民的責任，現今被迫強制休耕，但相關補助卻未盡合理，因而造成農民朋友很大的損失與反彈，為紓解農民的生計問題，市府決定編列預算，再補助休耕農地每公頃1萬5000元，未來也會繼續且積極的向中央爭取農民該有的權益，並呼籲行政院正視及解決白河水庫淤積的問題，避免農民權益再度受損。 2009年的八八水災為南部水庫帶進大量淤泥，白河水庫的蓄水量原為2253萬立方公尺，現淤積高達1283萬立方公尺，蓄水量只剩970萬立方公尺，直至目前，約只清除20萬立方公尺的淤泥，蓄水量嚴重不足，才使得644公頃農田被迫休耕。 農業局表示，這次擬對位於停灌區域內不種稻作且未種植其他作物但種植綠肥，及不種稻作且未種植其他作物者，每公頃補助1萬5000元，預估符合以上條件之面積為493.5公頃，所需經費約需740萬2,500元，受惠農民約有2000人。