溫泉法施行後，全台目前取得溫泉開發許可(包含供水證明)之溫泉業者，計有147家；取得溫泉標章者，計有39家。針對目前因申請成本較高、用地問題等因素導致尚無意願或無法取得合法登記的業者，水利署除完成全台計10個溫泉區之基本資料調查暨改善規劃計畫，供業者依循提出相關申請外，亦積極洽詢相關用地主管機關及縣市政府，透過會議協商、拜會面談等方式，希望在102年7月1日緩衝期限屆滿前，能順利輔導業者取得合法登記。 溫泉法立法意旨係為保育及永續利用溫泉，為期全面將溫泉業者合法納管，水利署推動於99年間修正溫泉法，增列簡易溫泉開發許可申請制度，無須水利技師及應用地質技師簽證，降低溫泉業者申請成本，並將溫泉法緩衝期限延長至102年7月1日，給予溫泉業者合理申辦溫泉合法登記，提高申請意願。 溫泉合法登記除依溫泉法規定辦理外，尚須遵循各目的事業法規，如土地使用管制規定部分，水利署多次與內政部、農委會、林務局等單位協商，有條件增列溫泉井為非都市土地使用管制規則之可容許項目；另水利署亦多次洽商原民會，以期解決原民地後續租用相關問題。 水利署已訂定溫泉資源保育管理計畫，與交通部觀光局、原民會共同成立溫泉輔導工作小組，並自6月底於全省辦理10場輔導業者說明會，全力協助各縣市政府推動溫泉業者取得合法登記，以期達溫泉資源永續利用之最終目標。