針對日前報導花博動用農委會預算，排擠農業預算事件，農委會表示，花博會補助預算，係由行政院經建會於公共建設計畫項下專案核列，絕無排擠農業相關預算。 農委會為擔任中央補助臺北市政府辦理花博的窗口，協助各項規劃落實執行，以兼顧農民權益及推動產業發展。 另吉園圃及有機農業之輔導為推動安全健康農業既定方針，農委會將持續加強辦理。 農糧署表示，2010臺北國際花卉博覽會是我國第一次正式獲得國際認證授權舉辦之世界級博覽會，從設計、規劃、營運、佈展、表演，全部是國人運用臺灣的創意及堅強韌性打造而成，完美呈現我國花卉產業、尖端科技、文化藝術、環境生態等軟實力，使用之花卉植栽達2,706種類、4,538品種，90% 由國內供應，透過契作及預約訂購方式採購，使農民直接受益。經台北市政府統計，展示期間吸引近900萬參觀人次，更創造出約430億元之經濟效益。 包含政府與民間企業投入效益約135.91億元，營運效益約176.78億元，以及所衍生帶動的產業關聯效果117.99億元，如扣除上述政府與民間企業投入經費，則舉辦花博會的淨效益約為294.77億元。 農糧署說，花博會總經費95億元，中央補助31.03億元，其中農委會補助預算28.5億元，分別於98年、99年編列，該補助經費係由行政院經建會於公共建設計畫項下專案核列，絕無排擠農業相關預算。 農委會依行政院指定做為中央補助臺北市政府辦理花博的窗口，負責督導花博會策劃、協調、聯繫相關工作，而由臺北市政府負責園藝花卉植栽採購、展覽館之興建、公共運輸服務等事務。 農糧署說，「健康、效率、永續經營」為農委會重要施政方針，迄目前已輔導通過吉園圃審查面積22,325公頃、有機驗證面積4,213公頃，實際推動面積每年持續成長，以99年度及前一年比較，通過吉園圃審查面積新增2,674公頃，有機驗證面積新增1,074公頃，未來將持續加強推動，讓農業成為守護國人身心健康及提升生活品質的重要產業。