南投縣政府工務處表示，依據水利署「溫泉取用費徵收費率及使用辦法」，自民國95年1月1日起到99年12月31日止，溫泉取用費徵收費率減半（每立方公尺4.5元）徵收。但水利署於去（99）年12月公告該辦法修正條文，減半徵收延長至民國102年12月31日止，並自每年3月1日起徵收，縣府提醒本縣溫泉業者依規繳納。 依據「溫泉取用費徵收費率及使用辦法」，明定溫泉取用費自民國95年1月1日起開徵，因溫泉水為國家資源，基於使用者付費原則，凡有實質取得溫泉水供自己或他人使用或收益之事實者，不論是合法或於緩衝期內尚未取得合法之溫泉取供事業或個人，皆應繳納。 工務處表示，溫泉取用量計算基準，縣府是依據經濟部水利署「溫泉使用現況報告書編制參考手冊」的溫泉取用量估算經驗式，並與業者充分座談溝通後，又參考其他各縣市計算標準調整估算經驗式，以取得公平合理計算標準。 工務處表示，所徵收溫泉取用費將專用於：溫泉資源保育及管理，促進溫泉資源永續發展及利用之研究發展，推動溫泉資源保育、管理及產業發展相關之國際交流活動，溫泉區公共設施相關用途，及徵收溫泉取用費之行政管理。