臺南市選舉委員會辦理第1屆市長、議員選舉，於99年10月29日（星期五）假臺南市立體育場（田徑場司令台）辦理候選人姓名號次抽籤，上午9時辦理市長候選人號次抽籤，由主任委員謝世傑主持，10時20分起辦理原臺南縣選舉區（第1至第9及第16選舉區）議員號次抽籤，由委員孫重輝主持；下午2時起辦理原臺南市選舉區（第10至第15選舉區）與原住民選舉區（第17、18選舉區）議員號次抽籤，由委員王志庸主持。 臺南市選舉委員會表示，市長候選人競選活動期間為15日（自11月12日起至11月26日止），市長候選人名單，將於市長候選人競選活動期間開始前1日（11月11日）公告；議員競選活動期間為10日（自11月17日至11月26日止），議員候選人名單將於議員候選人競選活動開始前1日（11月16日）公告。 里長選舉候選人姓名號次抽籤，則委由各鄉（鎮市、區）公所於10月29日上午同時辦理，里長之競選活動期間為5日（自11月22日至11月26日止），里長候選人名單將於里長候選人競選活動期間開始前1日（11月21日）公告。