苗栗縣政府表示，隨著國人在國際上頻繁的商業活動及旅遊因素下均使境外移入傳染病機會大幅增加，面對各種類型流感疫情急速擴散威脅及各種傳染病時，校園防疫工作必須考慮迅速性、有效性與整體性。 教育處體健科表示，為落實新型流感防疫工作，有效掌控校園疑似個案及確定病例，教育處與國立聯合大學災害防救科技研究中心合作完成「校園疫情監控管理資訊系統」建置，結合教育處、勞動及社會資源處、衛生局、消防局與地政處等單位提供之資料，強化各業管單位針對疫情做最迅速研判及介入之效率。 同時結合地理資訊平台方式，讓縣府決策者瞭解地區性疫情分佈情形，使決策者能作綜觀判斷及決定，以利救災資源有效配置與防堵疫情擴散。 教育處體健科說，監控管理資訊系統目前為短期即時監控系統，具有地理資訊系統之空間特性與圖形、文字資料及分析功能，透過網路讓第一線防疫工作工作人員能即時進入監控系統進行通報作業，自98年12月28日開始上線使用，截至99年6月28日止，使用者次數已達29,606人次，縣府各登錄人員數達1,283人次，通報筆數達58,704，各級學校總通報病例數達6,128件，其中流感996件、A行流感61件、新行流感35件、其他病例5,036件。登錄成果顯示本府教育處、衛生局、社會處及消防局可於第一時間有效掌握並監控各級學校疫情。 教育處體健科說，透過監控系統所建構出之各層級教育單位通報管控機制，已提供教育處與衛生局合作掌握苗栗縣各級學校校園疫情之資訊平台，並可彙報疫情資訊至教育部與行政院衛生署疾病管制局。 教育處體健科說，監控系統未來將朝校園安全管理通報及防疫決策支援等功能方向持續強化，並將結合教育部之學傳系統、校園安全暨災害防救通報系統、衛生署之法定傳染病監視通報系統，以及縣府教育處之校舍安全檢測、補強與整建等相關災害防救系統，以強化苗栗縣校園安全管理能力，提供苗栗縣學子們更安全的學習環境。