雲林縣家畜疾病防治所於6月22日接獲行政院農業委員會動植物防疫檢疫局通知，指出縣內養豬戶豬隻血清經例行性血清學監測發現口蹄疫非結構性蛋白（NSP）抗體呈陽性反應，防治所隨即於當日追蹤至該場進行豬隻臨床檢查、移動管制及疫情調查等工作，經查發現有部分豬隻出現水泡性病徵，防治所遂依規定立即通報防檢局，並隨即於當晚對疑患豬隻進行同欄撲殺工作，計撲殺豬隻163隻，同時進行全場消毒及採樣送檢工作，該批檢體於當晚由防治所人員運送至行政院農業委員會淡水家畜衛生試驗所做進一步檢驗。 對於疑患場豬隻防治所已完成口蹄疫疫苗全面強制補強注射，並對其畜舍及環境衛生進行徹底消毒等其他相關防疫措施，同時已將疑患場週圍劃定管制區域，半徑1公里內之養畜戶將實施全面疫情調查及全部強制補強注射口蹄疫疫苗，半徑3公里內之養畜戶加強畜舍及週圍環境消毒。縣府並將持續對區域內所有養畜場進行疫情調查及監控，請週邊場養畜場配合實施。 縣府平時即重視動物防疫工作並做好萬全的準備，請大家無需憂慮，同時籲請縣內養畜戶落實口蹄疫預防注射、牧場消毒及自衛防疫等相關工作，若發現豬隻等偶蹄類動物之口或蹄部出現異常病徵時，應立即向防治所或當地動物防疫機關通報；凡隱匿疫情者，依動物傳染病防治條例規定，業者最高可處新臺幣5萬元罰鍰。