雲林縣政府表示，根據縣府水利處與建設處的資料數據，雲林地區原本水資源供需就不足，加上中央政策必須將現有的水資源分配給工業使用，且以供應工業用水為優先，造成排擠到農業用水與超抽地下水情形出現。 而唯一的改善之道，就是中央重新檢討水資源的分配與政策，且投入更多經費，減少地下水的抽取，才是解決問題的治本之策。 水利處表示，雲縣境內的水資源主要來自濁水溪溪水，但濁水溪除供應雲林與彰化地區民生用水及農業灌溉用水外，也必須供給雲林離島工業區、南投縣名間發電廠與彰化縣八卦山高地旱作的灌溉用水。 濁水溪現有水資源供水的範圍相當廣，在供不應求下，造成雲林縣每年境內缺水量，高達五千萬噸至兩億噸之間，結果，因用水供給量不足，形成超抽地下水的現象出現，也讓雲縣沿海地區的地層嚴重下陷。 為穩定供應六輕離島工業區的用水，在每年濁水溪的枯水期，經濟部工業局均會編列2.2億元預算，向雲林與彰化農田水利會購水，兩縣水利會則展開作業，調度農業用水供工業用水使用，平均每日調度的水量達30萬噸，兩縣水利會雖因此每年各獲得1.1億元的收入，但也排擠到原有的農業用水。 縣府說，若盼改善此水資源分配不均現象，將建議中央重新檢討水資源政策、重新分配現有的水資源，並投入更多的經費 ，減少民眾對地下水的抽取，才能達到減輕縣內水資源不足、解決沿海地區地層持續下陷問題。