連日來的豪雨，讓原本還在估量全台水庫可否順利供水至六月底的水利署，必須瞬間進入防汛動員。 水利署副署長吳約西表示，因為這場及時梅雨南部供水壓力可說是暫時解除，評估全台各地區均可穩定供水到9月底，若後續降雨量正常，則至年底供水穩定無虞。 吳約西表示，這一波降雨各水庫上游集水區，也分別有不同程度的降雨，北部石門水庫約有68毫米水位上升0.61公尺蓄水率已達73.23﹪、中部德基水庫也有133毫米降雨，水位上升1.8公尺蓄水率達86.66﹪、仍有缺水顧慮的南部曾文及南化與烏山頭等三座水庫的集水區也分別降下216及180與110毫米的雨量，讓該等水庫水位上升，預估可為曾文、烏山頭帶來進水量可達4,000萬噸，南化水庫加甲仙堰也可帶來約1,100萬噸進水量。 吳約西說，因時序已進入汛期，隨著鋒面持續降雨，可增加水庫蓄水量，相關節限水措施已陸續解除，如：北部石門水庫當水位高於235公尺，取消相關夜間減壓及總量管制出水措施，中部地區取消夜間減壓措施，南部地區取消台南及高雄地區夜間減壓措施，同時取消南化水庫總量管制出水措施。 關於嘉南地區99年2期稻作供灌時程，因目前曾文-烏山頭水庫蓄水量約達2億2,000萬噸，且後續蓄水量應持續增加，因此應可正常供灌，但在不影響農作生長之條件下，將延後2週灌溉，並請嘉南農田水利會持續採取加強灌溉管理工作以節約灌溉水量。 水利署將持續密切注意全國水資源供需情勢，適時檢討各地區水源供需調配事宜，以穩定各標的之供水。 其中，屏東縣羌園排水雖仍有淹水情形，然以94年0602豪雨(日雨量130毫米)，即造成1至2公尺淹水及將近7天的淹水災情 ，該署易淹水地區水患治理計畫辦理10cms羌園抽水站、村落圍堤、排水幹線改善等急要治理工程後，這次豪雨，淹水深度已大幅降到30至50公分，淹水時間也減少至4到20小時，淹水戶數由1百戶以上減少至10戶以內，已大幅改善淹水情形，功效已逐步展現。 未來包括擬辦理及正施工中的羌園排水截流工程、大武丁排水截流工程、大武丁排水低地流路工程及大武丁排水出口閘門及抽水站工程完工後，更將可使羌園地區達到計畫保護標準。 吳約西說，工程保護有一定的保護標準，治理也需要時間，針對全球氣候變遷的效應，防災已不再僅止於工程手段，該署已公布全台易淹水的地區包括林邊、佳冬等14個村落，並且與各縣市政府擬定保全計畫，如有超過保護標準的颱風豪雨事件，也將由地方政府配合以疏散避災等非工程措施因應，呼籲住在易淹水地區內的民眾應有憂患意識並配合政府防救災措施，以確保生命財產安全。