雲林縣2處肉羊場於4月9日由特約獸醫師及肉品市場發現疑似感染羊痘，該2場立即由雲林縣家畜疾病防治所禁止羊隻移動，病原經行政院農業委員會家畜衛生試驗所電子顯微鏡檢查，結果確定為羊痘病毒，並於11日完成全數撲殺784頭及全場消毒。該病僅感染羊隻，係由直接接觸而感染，且非屬人畜共通傳染病，不會感染人類及其他動物。另媒體報導:3月份即採樣送檢證實「羊痘」之訊息並不正確。 羊痘為我國動物傳染病防治條例所列乙類動物傳染病，近年主要發生於中國、越南、蒙古及希臘等國，感染對象僅為羊隻。病症為羊隻皮膚出現紅疹及痘瘡，且係由直接接觸而感染。 為加強防疫，防治所籲請各養羊業者提高警覺，並做好自衛防疫措施，同時不要購買來路不明或走私之羊隻；對外購入羊隻應分群隔離飼養至少3週，確認安全無虞再混入羊群飼養，對於自己所飼養之羊隻發現異狀時，應立即隔離飼養並通報當地公所或雲林縣防治所。