台南縣政府表示，將軍溪因民國94年612豪雨，海棠颱風侵襲台南縣，破紀錄的豪雨造成將軍溪沿岸積水長達七天不退，為整治將軍溪解決淹水惡夢，縣府向中央努力爭取經費，終獲經濟部於96年1月12日核定辦理「將軍溪排水系統治理工程」經費，完工後經歷98年莫拉克風災考驗已不再溢堤，成效顯著。 現在將軍溪堤岸週邊，已經可以看到筆直的防汛道路與綠樹，沿岸居民可以免於洪患之災，今天於學甲鎮白礁亭舉辦完工典禮，為了慶祝完工啟用，現場還聚集了許多自行車友，準備暢遊這平坦的堤防道路。 縣長蘇煥智、縣議員侯澄財、學甲鎮長謝財旺、將軍鄉長陳進財、第六河川局副局長彭志雄、第七河川局副局長謝瑞章等人均前來參加。 蘇煥智表示，將軍溪排水治理工程是利用行政院八年八百億的治水經費來執行，這次八八水災已經可以看到成效，8月9日晚上至救災時整個學甲鎮公所都是救災人員，8月10日半夜蘇縣長決定無論如何都要想辦法調抽水機抽水，經過一整夜的搶救，學甲鄉親隔日大早起來可以發現街上道路積水已經退了。 經過這次八八水災學習到的經驗，後續將進行橋面箱涵及南外環道路地下箱涵的施工，工程改建後，未來學甲鎮和將軍鄉都將各有一個生態滯洪池及公園空間，滯洪池可作為臨時抽水站，再也不怕變成水鄉澤國。 蘇煥智進一步提到，地方居民反映的堤防道路路燈設置問題，初估所需經費約一千萬元，現正準備辦理發包，若路燈可採用太陽能設計未來可省下不少電費。 此外，也有居民反映樹木太少，乘涼空間不足，縣府將在河岸北邊種植一排樹木有助於綠美化，整個將軍溪畔將會不輸宜蘭冬山河，也計劃未來發展水上觀光，民眾未來還有機會坐船遊將軍溪暢遊馬沙溝、蘆竹溝。 目前完成渠道護堤，華宗橋至將軍溪橋部分，由經濟部水利署第七河川局施工，左右二岸共計9078公尺，工程費3億3430萬2000元，將軍溪橋至出海口部份，由經濟部水利署第六河川局施工，左右二岸共計4426公尺，工程費3億636萬3150元，未來縣府將持續爭取將軍溪華宗橋上游至麻豆排水匯流口改善工程、將軍溪排水舊河道護岸防護工程、橋樑改善及將軍溪排水下游左岸將軍中排至出海口整治工程等，如此才能完成將軍溪全面整治，降低淹水窘境。