基隆市政府表示，飲用水安全常是民眾所關注焦點，供應大基隆地區民生用水的新山水庫，水源主要來自基隆河，環保局分析歷年各項指標數據後，初判飲用水水質皆符合「飲用水水質標準」，並無影響安全之虞，請民眾放心。 民眾所關心的微囊藻毒問題，水質及土壤防治科表示，藻類雖普遍存在於國內各大水庫，但自97年起，該科每月派員會同該市自來水事業定期前往水庫進行巡查作業，並依淨水程序分段採樣進行「微囊藻毒」濃度檢驗，截至目前為止，自來水中均未檢出藻毒反應，可見微囊藻毒素目前當不至於構成本市飲水系統中的危險因子，其所帶來的環境衛生風險低，尚在可控管範圍內。 水庫優養化乃是藻類繁殖導致，因為大量營養鹽帶入水庫中，本市基隆河段之污染源多源自於民生、工業之廢(污)水流入河川，經抽取至水庫所導致，為降低水庫優養化程度，基隆市除已加速衛生下水道工程進度並提升用戶接管普及率外，在管制措施方面，本局已加強八堵抽水站上游工業、畜牧廢水及生活污水之查察管制、並組成河川巡守隊，對水源保護區內進行密集巡查工作，並將保護區內人為破壞或非法傾倒廢棄物污染河川之行為，予以重罰。 依據環保署90至98年每季對新山水庫進行「卡爾森指數(CTSI)」評估結果分析，近年除98年第3季因旱季導致優氧化指數為優氧狀態外，其餘各季均呈現「普養狀態」，且指數有逐年下降的趨勢。 歷經長期以來，各單位執行嚴格管制工作下，近年基隆河水質狀況也有所改善，依據環保署公布河川污染指標(RPI)顯示，以基隆河實踐橋測站為例，從96年中度污染(RPI值為3.04)至98年已下降為輕度污染(RPI值為2.63)。 同時，該市在「提升生活污水污染削減及處理改善相關工作」，98年經環保署評定為執行成果卓著縣市，顯見在水污染防治工作的努力。 綜上所述，目前民眾所飲用的自來水均經過完整處理程序才送至家戶使用，並經過環保局及水公司檢驗單位定期監測，經層層把關後才送至用戶家中，請民眾放心。