法務部推動廢除死刑，引發高度爭議。部長王清峰說，廢除死刑「不應是未來的事，必須是現在進行式」，目前暫停執行死刑，為的是能讓觀念慢慢發酵。 法務部自2005年12月後，即未再執行死刑，目前台灣共有44名判決定讞的死刑犯，仍羈押在看守所。 檢察總長被提名人黃世銘，日前在立法院審查會答覆立委表示，他個人贊成廢除死刑，但除非能訂出1個死刑暫緩執行條例，做為法源，否則目前已判決定讞的死刑案件，仍應執行。他若出任總長，會將死刑案件呈報法務部執行。 法務部日前由王清峰撰寫、名為「理性與寬恕─暫停執行死刑」的文章，內容指出，她可以理解黃世銘身為司法人的想法，但從人權角度，廢除死刑是為確保生命權，「人死不可能復活，確保生命權不應該是未來的事，必須是現在進行式」。 王清峰說，死刑是最危險的刑罰，因為審判的是「人」而不是「神」，同一套證據，可能因法官的判斷不同，使被告在死刑與無罪之間徘徊擺盪，蘇建和案就是1個例子。 死刑的存在或可使人心安，但實際上並無嚇阻犯罪的功能，「殺人償不了命，徒然使另一個家庭陷入永遠無法啟口的傷痛中」。 對於外界質疑44名死刑犯懸而未決，王清峰表示，目前全球有104國廢除死刑，超過10年不執行死刑的國家有35個，像南韓就有60名死刑犯，但也是10多年沒執行死刑，日本目前未執行的死刑犯更高達102名。 王清峰說，廢死政策的形成需要時間，暫停執行死刑是希望讓「理性與寬恕」能有充裕發酵的機會，讓法務部所規劃的廢除死刑替代方案，能慢慢獲民眾接受。 王清峰的公開信，形同宣告在她部長任內，絕不會批准執行任何一件死刑案。