監察院七月間就林毅夫叛逃案糾正國防部，國防部日前正式回覆監察院表明，即使政府允許林毅夫來台祭祖，其叛逃行為尚未終止，仍視為投敵罪的「繼續犯」，且由於林叛逃時是現役軍人身分，因此依軍法審判並無不妥，不適用於普通刑法「從輕從新」原則。 提案糾正的監委葉耀鵬表示，這是雙方對法律見解的不同，至於是否會因不滿國防部的回覆而進一步質問相關官員，葉僅表示，將再視情況而定。 國防部說，今年六月的跨部會會議中，專家學者多認為中共現今仍為與我國武力對峙的團體，其黨、政、軍及其控制的組織，係屬軍刑法中所稱的「敵人」，因此林毅夫的投敵行為至今仍未結束，要到其犯罪行為終了，才開始起算追訴期。