行政院長吳敦義3日天南下高雄視察芭瑪颱風防颱整備情形，高雄市長陳菊除詳盡報告各項防颱措施，也緊抓機會向吳院長建議延長「南星計畫」填土造陸，以收納南部地區河川疏濬土方，加速災區重建，也增加高雄港洲際貨櫃中心發展腹地，創造中央、地方政府與高雄港「三贏」局面；吳敦義院長聽取簡報之後，除表達感謝，也允積極促成。 另對於陳菊提出成立國家級壽山自然公園、加強排水防洪、旗津海岸保護等各項建設，吳院長也欣表同意，願於經費補助給予協助，並由中央與地方進一步討論。 陳菊表示，南星計劃預定在民國100年完成剩餘35公頃新生地填築，現在就可以提供南部地區疏濬土方進場處理，但是收納數量有限。她建議行政院延長與擴大新生地填築計劃，藉由河川疏濬土方來增加高雄港洲際貨櫃中心發展腹地，讓防洪治水與經濟發展並行不悖，透過「土方銀行」中介，還可將收入盈餘挹助地方財政。 陳菊更以高雄市經歷莫拉克颱風88風災的經驗，呼籲行政院重視西子灣與旗津海岸線侵蝕問題，同時列入國土保育重要工作，提升主管機關層級，確立權責。她也尋求吳敦義院長支持、挹注經費，在高雄縣市交界澄清湖週邊興建滯洪池，強化調節水位功能，以助解決哈瑪星與愛河中下游地區的水患。 另針對先前有關石灰石礦產開發的爭議，陳菊也以吳敦義院長在擔任高雄市長任內曾反對開放開採壽山、半屏山及駱駝山3處石灰石礦產，至表認同，向吳敦義院長爭取支持高雄市政府將柴山劃為自然公園的都市計劃，停止一切開採石灰岩及土地標售行為，為現在及未來的高雄市民留下珍貴天然資產，防範過度開發所可能造成的嚴重災害。