第1選舉區選出之第7屆立委吳敦義，於97年2月1日就職立法委員，立法院98年9月10日函知該會吳敦義自98年9月9日起辭去立法委員職務。 選舉委員會25日舉行委員會議，會中討論通過第7屆立法委員南投縣第1選舉區缺額補選投票日，訂於民國98年12月5日舉行 。 中選會說，經該會邀集南投縣選舉委員會及各組室召開研商，今年年縣市長、縣市議員及鄉鎮市長選舉，經定於12月5日舉行投票，考量上開缺額補選之完成期限規定、便於選民投票及撙節選務經費等因素，乃將這次補選投票日期訂為同一天舉行。 委員會議同時討論通過，缺額補選工作進行程序表，主要工作日程如下： （1）98年9月25日發布選舉公告。 （2）98年10月1日公告候選人登記日期及必備事項。 （3）98年10月5日至10月9日受理候選人登記之申請。 （4）98年10月9日政黨推薦之候選人政黨撤回其推薦截止。（5）98年11月6日前審定候選人名單，並通知抽籤。 （6）98年11月11日候選人抽籤決定號次。 （7）98年11月15日選舉人名冊編造完成。 （8）98年11月24日公告候選人名單與競選活動期間之起、止日期及每日競選活動之起、止時間。 （9）98年11月25日至12月4日辦理公辦政見發表會。 （10）98年12月1日公告選舉人人數。 （11）98年12月5日投票、開票。 （12）98年12月11日前審定當選人名單。 （13）98年12月11日前公告當選人名單。 （14）98年12月21日前發給當選證書。 （15）99年1月10日前通知候選人領取補貼之競選費用。