馬英九政府這次救災行動，不僅讓全國民眾看破手腳，國際媒體也紛紛搖頭。 法新社發自台北的分析報導指出，這次顢頇無能的救災表現，為馬英九帶來一場政治災難。 報導中說，馬英九到災區勘災時，隨扈為保護他而一再推擋災民，而在事事逃避之後，他犯下的一連串大錯仍有待彌補，包括拒絕外援、一開始接見災民時態度既傲慢又冷漠，以及接受英國獨立電視網ＩＴＮ訪問時，把責任歸咎於災民沒有在第一時間撤離等等。 馬英九在日前接受美國有線電視新聞網專訪時，雖強調願意負起完全責任，卻仍再度堅持「災民拒撤」論。 政治大學政治分析家童振源表示，馬英九靠「我們準備好了。」口號選上總統，但如今民眾看到他的政府做得這麼爛，這可能重創他的聲望。 報導中說，自上任以來，馬英九透過親中政策來提振台灣經濟、抵擋反對黨指控他犧牲國家主權的批判，靈巧地遊走於台灣的政治鋼索上，不過在這次風災之前，這位前台北市長及哈佛法學院畢業生，並未真正受到危機考驗。 一直到水災第七天，馬英九才首度召開救災國安會議，並撤換中央災害應變中心指揮官。 文化大學政治學者蔡瑋告訴法新社說：這個政府缺乏組織、效率，犯下許多錯誤，民怨節節升高，對政府的信心已經動搖。 不過，馬英九的危機尚未過去，更大的挑戰就在眼前：未來災區的重建如何規劃、必須投入多少預算，以及如何安置災區的原住民等。