莫拉克颱風在南投帶來不少災情，縣長李朝卿9日上午馬不停蹄前往受災地區勘災、撫慰災民，並前往水里慰問台十六線遭洪水沖走的賴光明、賴連惠家屬，表達關懷之意。 李朝卿9日上午主持災害應變中心會議後，立即驅車前往集集、水里、信義等地勘災，希望在颱風過後第一時間，全盤掌握最新災情，便於規劃重建事宜。 李朝卿勘災第一個行程，選定台十六線11公里處的坍塌處，進行了解。台十六線在9日凌晨5時，因路基遭濁水溪洪流淘空，發生小貨車墜溪事件，駕駛人賴光明及其女兒賴連惠遭洪水沖走，下落不明。 縣長李朝卿、立委吳敦義、林明溱、集集鎮長莊瑞麟等人冒著風雨，達出事地點時，工程單位正緊急投放消波塊，避免台十六線路基崩塌擴大。 為避免類似事故再次發生，將建議水利局、公路工程等單位，檢討施工方法，例如水利單位應在濁水溪床中央辦理疏浚，避免洪水來時沿著兩岸沖刷，造成意外。 隨後，縣長李朝卿、立委吳敦義、林明溱等人前往水里義民廟慰問受災的新山村村民。這次颱風過境，新山村不但道路坍方，9日凌晨有多戶民宅被洪水沖走，新山村民在製茶廠度過驚恐的一夜後，清晨五、六點才從產業道路脫困，約有七十多人集中安置在水里義民廟，部分受災民眾看到縣長李朝卿等人前來關心，不禁悲從中來，忍不住落淚，縣長李朝卿則極力安撫受災民眾，表達關懷之意。 李朝卿表示，看到新山村民眾受災，他感到很不捨，縣府、縣議會、立委吳敦義、林明溱及公所等單位，將攜手努力，幫忙民眾重建家園。吳敦義、林明溱也表示，他們將配合地方需要，全力向中央爭取協助。 李朝卿等人探視新山村受災民眾後，隨即趕往在台十六線墜溪失蹤的賴光明、賴連惠家中，慰問賴光明的妻子廖秋蘇並致贈慰問金；他並計畫趕往降雨最多的信義地區了解災情，但車抵龍神橋後，由於雨勢仍大，且洪水不斷而封橋，李朝卿查看龍神橋附近堤坊後，這才結束勘災行程。