縣長蘇治芬9日上午至災害應變中心召開防災會議，聽取各進駐單位工作報告，指示災害應變中心與20鄉（鎮市）鄉長聯絡，了解各公所目前防災需求及其須協助事項，並請各鄉鎮市指揮官檢查轄內之水溝排水孔是否通暢，及排水匣門運作是否正常，以做好防災工作，確保民眾生命財產安全。 蘇治芬表示，為因應莫拉克颱風所帶來龐大雨量，縣府各單位務必加強防災各項準備，針對施工中的各排水工程，了解有無防汛缺口，並準備沙包袋等應急物品備用，另對各地水閘門、抽水機和抽水站應確保順利運作。 蘇治芬指出，莫拉克颱風期間，相關人員必須待命及注意災情，手機24小時暢通，隨時回報災情，並請消防局掌握各地災情回報、備妥救生裝備器材，隨時注意各溪流水位變化，對於住在低漥地區民眾，呼籲遷往至安全處所。 雲林縣災害應變中心表示，受莫拉克颱風影響，大埤鄉三結橋、林內鄉南雲橋、西螺大橋及大埤鄉與斗南鎮交界豐岡橋（雲86線），因溪水暴漲至橋樑橫樑，暫時封避通行，請民眾繞道而行，颱風所帶來龐大雨量，請養殖戶就魚塭之水量，作適度調節。另古坑鄉草嶺村境內石縵坑、鹿掘仔野溪、東碧山莊野溪、水溓洞野溪、竹篙水溪、古坑鄉華山村境內華山橋野溪、科角橋野溪、古坑鄉桂林村大湖口溪支流及樟湖村石橋野溪等9區域為土石流危險地區，請民眾勿穿越該區。