2009世界運動會即將於7月登場，惟面對新流感疫情可能影響世運舉辦，高雄市多位議員均提出質詢。對此疑問，高雄市長陳菊重申市府立場，承辦城市無法單獨決定停辦與否，強調相關單位將持續針對疫情進行「動態評估」，5月10日也將與國際世界運動總會（IWGA）召開聯席會議，進行相關討論，務求「做作最周延的準備」。 高雄市議會4日進行市政總質詢，陳菊率市府局處首長出席備詢。對於新流感的疫情，陳菊除再次說明相關防治工作，也進一步表示已向行政院轉達需要六億元經費建置或者整修九處收容中心，陳菊說，若評估後真的需要，約需一到二個月建置，一定在世運開幕之前完成。高市府衛生局長何啟功表示，目前防疫以小港和民生醫院為第一線，若民眾要通報疫情，請打1999專線。 同時，陳美雅議員對小蝦米商業貸款之相關預算編列提出質詢，認為審查流程應該公開透明，並釐清究竟是捐助或者提供保證性質。對此，陳菊強調若有必要，將責成相關單位進行了解。「高雄市政府小蝦米商業貸款」是由高市府及信保基金共同提撥，提供高市有資金需求的公司、行號及合法攤商依規定申貸，根據高雄銀行統計，目前已有66件完成核貸。 另外，陳漢昇議員也針對西子灣海灘使用及鼓山旗津間舢舨船議題提出質詢，李永得副市長表示，日前已與中山大學校長會面，表達希望西子灣能開放給全體高雄市民的立場，獲致具體進展，中山大學將提出相關的動線規劃。陳市長則表示，陳漢昇議員提出鼓山旗津間公營船舶夜間行駛以及假日增駛船班建議，將責成交通局進行專業評估。