腸病毒疫情每年約自4月份進入流行季，於5月底至6月中達到高峰，而後於9月份開學後再度出現另一波流行，時值流行期為防範腸病毒發生，嘉義巿政府衛生局正加強一系列的宣導及防治積極作為，除已於4月1日及2日動員所有防疫人力完成全巿119所國小、幼稚園、托兒所等易感染高危險場所之消毒及洗手設備查核、輔導，另，自4月11日起每週六及週日，由衛生局(所)及環保局派員巡迴至各國小、幼稚園、托兒所進行環境消毒，除此之外，為落實正確洗手，防範疫情在校園發生，嘉義巿啟動跨局處腸病毒防治小組及監控機制，4月7日教育處余坤龍處長及衛生局孫淑蓉局長等人，採無預警方式前往博愛國小、僑平國小，隨機抽查校長、衛生組長、校護、導師及學童正確的洗手時機及正確洗手動作，小朋友不但對答如流，洗手動作更是毫不馬虎，衛生局並致贈每位測驗過關的小朋友一份貼心小禮物，以茲鼓勵，日後嘉義巿腸病毒防治小組仍將不定期持續進行學校之抽查工作。 98年腸病毒重症確定病例皆為腸病毒71型感染，該型病毒傳染力極強，民眾應留意並做好防範措施。嘉義巿政府衛生局再次提醒民眾，腸病毒的傳染力極強，但可透過簡單的衛生保健動作，有效降低感染的機會， 3歲以下嬰幼兒因為免疫力較低，大部分無抗體，是腸病毒重症的高危險群。因此，民眾平時要注意自身與嬰幼兒的衛生習慣，自外面回家後，摟抱、餵食嬰幼兒前，大人及小孩務必正確洗手，流行期間，避免出入人潮擁擠，空氣不流通的公共場所，以降低嬰幼兒感染腸病毒的機會。 衛生局表示洗手為防範傳染病最佳方法，籲請民眾應落實並督促小朋友落實「洗手五時機」及「洗手五步驟」，「洗手五時機」就是「用餐前」、「如廁後」、「擤鼻涕後」、「看病後」、「與小朋友玩前」為洗手的五個重要時機，「洗手五步驟」濕、搓、沖、捧、擦，方能有效打擊腸病毒。若家中嬰幼兒經醫師診斷感染腸病毒時，小心處理病患之排泄物（糞便、口鼻分泌物），且處理完畢應立即洗手，並注意觀察患者是否出現腸病毒重症的前兆病徵，例如「嗜睡、意識不清、活力不佳、手腳無力」、「肌抽躍（無故驚嚇或突然間全身肌肉收縮）」、「持續嘔吐」與「呼吸急促或心跳加快」等，請務必立即轉送腸病毒重症責任醫院，本巿為嘉義基督教醫院及天主教聖馬爾定醫院，接受適當治療，以免錯過治療的黃金時間。