針對潮寮空汙事件，經濟部工業局原已簽署同意書，同意依居民就醫、受害分級進行賠償，事後卻又致函縣府陳述不同意見。為此，縣長楊秋興深感遺憾，24日在縣府主管會報指示環保局，趕快行文工業局，請其儘速辦理賠償，不要等到人民再次抗爭、包圍才要做。 衛生局長黃志中表示，縣府為加速潮寮空汙事件賠償等事宜，曾於今年2月11日邀集環保署、健康風險評估小組、經濟部工業局、大寮鄉長黃天煌及潮寮三村村長等代表，就受害居民就診及身心健康影響情形召開健康影響評估會議。 會中達成共識，根據這次事件緊急就醫系統名單，依多次住院、急診或就醫過程，有明顯生理、心理影響作分級，結論共分為七級。這項標準經過三大醫學中心及專家學者制訂，工業局代表也當場簽署共同同意書，將會同肇事廠商展開相關賠償事宜。 事後，工業局卻發函給環保署、衛生署及縣府，表示對該次會議結果表達分歧觀點，甚至持反對意見。而衛生署則回覆工業局，這次的分級是經過現場出席代表同意，若工業局持不同意見，應於當場陳述，因此，衛生署建議工業局應按照當天會議結果執行為宜。 楊秋興表示，事發以來，工業局態度反覆、傲慢，幾次會議出席代表都非決策層級，這是不負責任的作法。且縣府非工業局下級機關，居然要求縣府重新召開會議，簡直是打專業醫生、學者的巴掌，縣府絕不可能再次召開協調會。 他表示，七等級的賠償標準是經過三個醫學中心制訂，結論又獲得中央的認可，工業局不要等到人民再次抗爭、包圍才要負責，這不是做事情的態度，他指示環保局儘速行文給工業局，請工業局加快賠償動作，還給人民一個公道。