針對違章房屋是否仍應設籍課稅？嘉義市政府稅務局表示：一般民眾普遍於房屋頂樓、一樓前後搭蓋建物，或利用原有陽台加蓋以增加房屋使用空間，對自行搭建之違章建築，因係附著於土地上並有增加房屋之使用價值，在未拆除前仍為房屋稅課徵對象。 另外，合法申請使用執照之房屋，應向稅務局辦理稅籍設立繳納房屋稅外，對於不合法之無照違章房屋亦需申報課稅而無例外情形，但由於民眾常疏於主動申報，稽徵機關基於稅法規定及維護租稅公平原則，每年均會依財政部指示，辦理房屋稅籍及使用情形清查，如有上開增建情形被查獲，將併入房屋稅籍課徵房屋稅，而房屋稅之完納，僅表示納稅義務之履行，無法使違章房屋就地變成合法。 最後，稅務局提醒房屋納稅義務人應於房屋建造完成之日起30日內檢附有關文件，向當地稽徵機關申報房屋現值及使用情形，其有增建、改建亦同。若未依規定辦理申報，因而發生漏稅者，除責令補繳應納稅額外，應按所漏稅額處以2倍以下罰鍰。